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若何使用FEFF推算资料属性

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FEFF是一个用于推算引发光谱和电子结构的重新算多沉散射代码。它基于真实空间的格林函数步骤,蕴含屏蔽主题孔、非弹性损失和自能位移以及德拜-沃勒因子?裳〉,FEFF蕴含部门。═DLDA)和多电子引发的近似处置。光谱蕴含扩大x射线吸收精密结构(EXAFS)、x射线吸收近边结构(XANES)、x射线天然和磁性圆二色性(XNCD和XMCD)、自旋极化x射线吸收光谱(SPXAS和SPEXAFS)、非共振x射线发射光谱(XES)、康普顿散射、非共振非弹性x射线散射(NRIXS),以及x射线散射幅度(蕴含汤姆逊和异常部门)。此表,该代码还能够处置相对论电子能量损失谱(EELS)。FEFF9.6是用Fortran 90编写的,能够从基于Java的图形界面运行。

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1. 概述

FEFF推算从两个根基工作起头:推算电势,而后推算散射相移。利用这些相移,能够找到散射蹊径并推算其散射振幅。有两种步骤能够做到这一点:要么使用显式枚举和求和,适合扩大吸收光谱;或者使用合用于近边缘吸收光谱的全屡次散射的隐式求和。之后,这些散射振幅被组归并处置成一种特定类型的光谱——目前是EXAFSXANESELNESEXELFSXESNRIXSDANESCOMPTONXMCD。

这些根基步骤中的每一个都对应于由一组“FEFF.inp”输入选项节造的少数FEFF法式?。本文选取了越发面向用户的步骤,别离会商每种类型的光谱学,指出了哪些选项(卡)和法式?橛敫美嘈偷钠灯子泄,并给出了战术建议和示例。

用户花一些功夫浏览FEFF刊行版附带的“examples”文件夹。大无数用户会在~/jFEFF_examples中找到这一点。(若是你只装置了FEFF代码,示例在~/FEFF90/examples中。)这个文件夹蕴含几个测试用例,蕴含全数重要类型的光谱学。每个测试用例都带有一个输入文件“FEFF.inp”、一个引用输出文件“referencexmu.dat”或“referenceeels.dat”,以及一个蕴含整个推算和中央输出文件的归档文件“reference.zip”。新手用户能够接见FEFF:您只必要一个输入文件“FEFF.inp”,而后运行一个号令“FEFF”(或GUI中的“保留并运杏妆按钮)。

2.?运行FEFF?

深刻相识FEFF的根基结构。例如,能够扭转很多参数,而不必要沉新进行整个推算。若是模型(即原子地位)没有显著变动,通常不必要沉新推算势。例如,若是要在蹊径扩大中增长更多蹊径,则能够使用?轷杈冻列缕舳扑,从而节俭大量功夫。若是要在EELS推算中更改波束方向,则只必要再次运行EELS?。但是,对模型的沉大更改必要沉新运行整个推算。通常,potfmsgenfmt必要破费大量功夫,而全数其他法式?槎己芸。对一种资料的钻研通常必要进行屡次推算,由于有一些参数必要收敛,例如全屡次散射算法的截止半径。这些参数没有合用于全数材质的默认值。在EXAFS造度中,德拜-沃勒成分可能必要更多关注,但XANES造度可能不那么敏感。必要一些尝试能力找出对给定资料来说什么处置是足够的。

2.1 筹备输入FEFF法式由一组由单个输入文件“FEFF.inp”驱动的法式?樽槌。用户能够自己提供该文件;或者能够通过JFEFF?GUI设置全数输入选项,该GUI运行FEFF而不必要手动文本编纂。(“FEFF.inp”是在后盾创建的,以来能够编纂。)要筹备FEFF输入,您必须回覆四个问题:

1. 我在仿照的资料是什么?

2. 我对什么光谱感兴致?

3. 我但愿FEFF若何进行仿照?

4. 我想跑FEFF的哪些部门?

问题1的答案必要相识结构。在大无数情况下,这意味着获得xy、z Carthesian原子坐标和原子序数的列表。FEFF对原子的明确列表感应中意,例如分子、非周期系统或作为周期资料的近似。FEFF还能够读取“.cif”文件,这是一种被宽泛接受的暗示晶体数据的体式。在线数据库中的好多资料都能够找到此类文件,这些文件能够直接输入JFEFF?GUI,也能够链接到“FEFF.inp”文件中。而后,还有一些第三方工具能够凭据原子地位或晶体学信息为您设置“FEFF.inp”文件。一个例子是B.Ravel开发的网络原子;或者雅典娜打算。ICMPE提供了更多与FEFF兼容的晶体学工具。

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2023-03-30 17:04
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