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TOPAS-Academic 教程 - PbSO4峰值拟合与索引

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在这个教程中,我们将对PbSO4的尝试室X射线数据进行索引,首先进行峰值拟合,而后使用这些峰值地位和强度进行索引运算 。

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PbSO4峰值拟合与索引

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首先在jEdit中点击图标1xBET·Signup(中国区)-官方网站,从浏览器当选择文件TA-Tutorials\data\rutile\d5_05005.raw 。选择数据文件后,将在统一目录下创建一个名为 .inp 的topas运行输入文件 。

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此刻我们使用TA来获取初始峰值地位进行峰值拟合 。在TA中使用“文件/导入数据文件”菜单选项加载pbso4.raw文件 。通过查抄图案,能够看出拟合从15到61度2Th的x轴区域应足以进行索引 。

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在TA中使用“查看/搜索峰值”菜单选项插入峰值 。查抄插入的峰值,并增长/移除峰值,使它们的地位看起来合理 。

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发展TA树视图到“峰值阶段”,点击名为“地位”的列标题 。右键点击黄色列并执杏装复造全数/选择” 。这会将峰值地位复造到剪贴板 。TA屏幕应如下所示:

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将峰值地位粘贴到jEdit中 。

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打开XInsert节点“TOPAS-Academic, INP体式/扫描文件级别” 。点击“发射谱图”并插入CuKa5发射谱图 。

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打开XInsret节点“布景”并点击“Chubychev” 。

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打开XInsret节点“仪器”并点击“衍射仪半径”、“狭缝宽度”、“发散角”和“全轴模型”;输入适当的仪器值 。

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打开XInsret节点“杂项”并点击“肇始_X”和“实现_X”,输入适当的值 。

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打开XInsret节点“阶段级别 - xo_Is”并点击“xo_Is”、“CS_L”、“CS_G”、“Strain_L”和“Strain_G” 。

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将峰值地位放在“load xo I { }”文本的大括号内 。

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jEdit屏幕此刻应如下所示:

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请把稳,用户通常应该相识与接管狭缝宽度、轴向发散参数、发散、发射谱图等有关的仪器前提 。

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未蕴含零误差,由于峰值能够独立移动 。由于不必要峰值强度,也没有蕴含洛伦兹偏振因子 。

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还请把稳,使用xo_Is阶段来拟合峰值,并且jEdit列光标用于插入'@'列和'1'的强度 。

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此时,可能有效的是相识jEdit列复造/光标职能 。若是已装置INP按键,则创建列光标:

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按Ctrl-KeyPad_Plus;jEdit状态行应显示一个“R”,暗示矩形模式开启 。

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按住Shift键并向下箭头,你应该看到一个列光标 。

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键入字符@,你应该看到一个'@'字符的列 。键入另一个字符看看会产生什么 。

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要剪切列,请按Ctrl-KeyPad_Plus,按住Shift键并使用箭头键选择所需的矩形 。按Shift-Del剪切列 。移动到您但愿粘贴列的地位并按Shift-Ins 。

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要关关矩形模式,而后按Ctrl-KeyPad_Minus 。请把稳,在jEdit中列复造/粘贴功效较好,花一两分钟功夫熟悉它是值得的 。在XInsert节点“TOPAS-Academic, INP体式 / 援手”下佑装键盘基础知识”,值得一看 。

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点击图标1xBET·Signup(中国区)-官方网站 ,它将当前INP文件的名称发送到主TA目录下名为LAUNCH_FILE.TXT的文本文件中 。这只是批示TA槽作此INP文件 。

Alt-Tab切换到TA并进行微调 。峰值拟合应如下所示:

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沉要的是仔细查看拟合情况,并确保峰值在拟合过程中没有偏离其大体地位 。显示的垂直峰值线有助于此过程 。请把稳,TA的演示版本不显示峰值线 。

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索引

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此刻我们将在索引运行中使用精辟的峰值地位 。

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将pbso4.inp文件另存为名为indexing.inp的文件 。我们将批改此文件以执行索引 。

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删除INP文件中除了峰值地位和强度之表的所有内容 。

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打开名为“索引”的XInsert节点,沿树向下工作,使INP文件看起来如下所示:

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点击图标 1xBET·Signup(中国区)-官方网站Alt-Tab切换到TA并进行微调 。

索引运行产生一个与INP文件同名但扩大名为NDX的文件,并且位于INP文件的统一目录中 。将此文件,INDEXING.NDX,加载到jEdit中 。一部门应如下所示:

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这里我们看到正确的晶格参数已被确定 。请把稳,PbSO4的空间群是Pbnm 。FOM蕞高的解是Pna21 。然而,就粉末数据而言,Pna21与Pbnm有一样的线;拜见技术参考的第12.6表 。因而,确定了正确的空间群分组 。

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indexing.ndx中蕴含的解决规划能够使用TA图形化地查看 。

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首先使用TA菜单选项“文件/导入INP文件”将indexing.inp加载到TA中 。

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从jEdit复造indexing.ndx文件的全数内容到剪贴板 。Alt-Tab切换到TA 。点击索引领域的解决规划选项卡并执杏装粘贴INP到节点/选择”选项 。点击其中一个索引解决规划,TA屏幕此刻应如下所示:

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请把稳,对于319的真实解的倍数的体积观察到高FOM值 。

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还请把稳,当使用GUI不理解的关键词时,将indexing.inp加载到TA中是不成能的 。在这种情况下,能够使用TA的“全局”树视图项下找到的“创建索引领域”选项手动创建一个索引领域 。创建索引领域后,能够将2Th/强度峰值从jEdit复造并粘贴到TA的“数据”选项卡中 D芄皇褂肨A菜单选项“窗口/新建扫描窗口”创建一个用于显示索引峰值地位的窗口 。因而,索引解决规划的图形显示总是能够轻松显示的 。

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这实现了峰值拟合和索引 。

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2023-12-06 11:00
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