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粉末衍射结构求解软件Endeavour职能:结构解决规划向导

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本页介绍了Endeavour所谓的“结构解决规划向导”易于筹备结构解决规划过程 。

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  • 第1步(共8步):

界说像元参数和空间组

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必须知路单元参数,即粉末数据必须假造索引,而不必要知路正确的空间组 。始终能够在P1中进行推算,而后确定正确的空间组 。但是,若是空间群是已知的,则推算速度要快得多

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  • 第2步(共8步):

界说分子(可 。

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Endeavour支持使器拥有柔性旋转角的分子和不位于空间群特殊地位的刚体碎片 。分子能够固定在肯定的地位,并能够沿着参考原子旋转 。

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  • 第3步(共8步):

界说晶胞

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输入单元格内容,即单个原子(即不属于分子的原子)的公式和和每个单元格的公式单元数 。

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  • 第4步(共8步):

界说衍射数据

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向导的下一个页面专门用于衍射数据的输入 。您能够打开筹备好的蕴含衍射数据的文件,作为2 theta-和相应强度值的列表,或者,在本例中,作为|F|(hkl)数据的列表 。

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  • 第5步(共8步):

可选择自动和手动结构解决规划设置

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从1.6版本起头,在输入细胞参数、空间基团、分子、单原子、衍射数据后,所有结构溶液推算参数都能够自动调整 。这是默认的和建议的设置,您将被疏导到向导的末尾一页 。(在这个例子中,我们持续下一页 。)

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  • 第 6 步(共 8 步):

界说电位的设置

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这个页面专门用于输入推算势能所需的数据 。有三种可能的函数能够使用,其中两个-“单一倾轧势”和“伦纳德-琼斯势”-必要经验参数 。在1.3版本中引入的“霍夫曼势”使刚性分子的晶体结构求解变得越发容易,还能够在不使用任一粉末衍射数据的情况下预测刚性分子的晶体结构 。因而,它不蕴含任一必须由用户调整的参数,使其使用极其单一 。关于其他两个电势,Endeavour的设计很仔细,出格使电势参数的天生尽可能单一 。

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  • 第 7 步(共 8 步):

界说优化设置

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此页提供了一些关于优化的选项 。例如,所谓的“成本函数平衡”能够调整,即成本函数的两个部门中的任一部门对整体价值的贡献 。因而,弱衍射数据可能在肯定水平上被高质量的电位所平衡,反之亦然 。除此之表,推算速杜咨滑块“优化速度”节造,它能够取1到10之间的任一整数值 。值为10意味着蕞快的优化速度,但由于底层的仿照退火优化步骤,成功概率也蕞低 。

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  • 第8步(共8步):

界说环境设置

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由于Endeavour不仅是结构解决规划的法式,也是一个结构可视化法式,因而您能够在结构求解过程中查看中央结构 。在向导第7页,您能够通知法式应该若何实现此作为 。

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从1.5版本起头,您能够通过“结构解决规划的高端设置”对话框查看更多参数, 可从“结构解决规划向导”的末尾一页获得 。 例如,您能够将分子视为柔性分子而不是刚体分子,或者允许将分子的原子搁置在特殊地位(这是1.8版中的新职能):

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创建功夫:2024-06-24 17:00
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