Endeavour- 粉末衍射结构求解软件
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Endeavour是一款职能壮大的晶体结构解决规划软件,来自粉末以及单晶衍射数据;谑嗄甑木,该软件可能自行或多或少地解决很多中幼型结构。创新的概想与精彩的用户界面相结合,使得晶体结构的解决规划险些成为通例过程,出格是对于无机化合物,但也合用于很多有?机化合物。
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即便是没有经验的用户也能够在几个步骤中筹备和执行结构溶液推算:只需依照集成的“向导”输入所需的数据(单元胞参数,化学成分,衍射数据),而后让Endeavour实现其余的工作。结构解是使用一种特殊的“直接空间”步骤进行的,即对推算和观测的衍射数据之间的差以及系统的势能进行组合全局优化。由于额表使用了势能,该步骤对低质量衍射数据的活络度远低于直接步骤。
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2018年10月11日颁布的Endeavour的新版本1.8拥有沉新设计的用户界面,这是我们从粉末数据中解决晶体结构的软件。此新版本蕴含多项改进和各类谬误建改:
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新的“表观和感触”
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用户界面的设计已经过美满。
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教程中运行RuS2和BaMoCl6示例的版本的屏幕截图
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选项卡式多文档窗口界面
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- 多文档界面(一次处置多个结构文档)此刻拥有选项卡式界面。您能够轻松单击选项卡以切换到其他文档。要并排查看两个(或多个)文档窗口,只需将相应的选项卡拖到右侧即可。当您放下标签(即放松鼠标按钮)时,半通明象征将显示指标地位。
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结构解决规划进度此刻在?看翱
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- 结构解决规划进度图形此刻呈此刻?看翱谥,一次显示多个种子值和/或文档的图形。该窗口能够一次显示多个进度图,新的在顶部。通常,当前运行的推算在顶部,下面是以前使用种子值的推算。进度图不仅能够显示活动文档或选定文档,还能够显示所有当前打开的文档,即显示所有选项卡文档窗口。
- 您能够撕下窗口(将鼠标指针移动到窗口的标题,按下鼠标左键并移动到其他地位)并使其维持浮动, 或者您能够将其?吭贓ndeavour利用法式窗口的左侧。 此窗口能够通过“关关”按钮(右上角的十字符号)关关。 在这种情况下,能够通过从“视图”菜单当选择“进度窗口”或单击Endeavour工具栏中的“进度窗口”按钮来再次显示进度窗口。
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注: 此?看翱谌〈艘郧暗母《敖却翱凇保≒rogress Window) 浮动“进度窗口”对话框窗口,该窗口仅在结构求解推算期间显示。
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R因子和成本函数值
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- 每个进度图(用于运行结构解推算)都能够在一个图中同时显示R值和成本函数值或两个值在彼此上方的两个分歧图形中。您能够使用“折叠”或“发展”按钮在这两种暗示大局之间切换。
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援手系统和文档的改进
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- 新的基于HTML的联机援手系统取代了过期的(在Windows Vista到10下不再受支持)“Windows 援手”系统。
- 一个单独的手册和教程文件,蕴含(现已作为单独的 PDF 文件过期)“Endeavour内核剧本参考”,“文件体式”和“急剧入门教程”,拜见“援手/手册和教程”。
- 新设置(当关关Endeavour时)此刻存储在Windows注册表(HKEY_CURRENT_USER\Software\Crystal Impact\Endeavour)中,而不是贮存在“C:\Windows”目录下的“Endeavour.ini”文件中。
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结构求解过程的改进
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- 蕴含分子/刚体的晶体结构此刻能够直接在P1以表的空间群中求解,即便它们的原子必须搁置在特殊地位。
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Bug建改
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- “无法启动联机援手”新闻:基于“Windows援手”(Endeavour.hlp)的过期的在线援手系统已被新的基于HTML的在线援手系统(Endeavour.chm)所取代。
- 在某些Windows 10系统上,当您单击一行时,例如在原子参数表或多个对话框窗口中的表中,Endeavour崩溃。
- 若是两个中性原子的距离幼于蕞幼距离,则两个中性原子之间的倾轧力减弱。
- 即便刚体被固定在某个地位(只允许旋转),也允许互换刚体的地位。了局,看起来正本固定的分子在移动。
- 当您在分歧的配置之间切换时(例如,配置列表高低文菜单中的“选择配置”指令)并且某些原子的S.O.F. <为1,这些SOF不会被复造到当前结构参数中(例如,在原子参数对话框中显示为1)。
- 在配置之间切换时,了局汇报未正确更新。
- 以Ihkl体式导出衍射数据时,将Fhkl而不是Ihkl值写入输出文件。
- 还建改了几个幼谬误。
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【英文介绍】
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Endeavour is a powerful software for crystal structure solution, both from powder as well as single crystal diffraction data. Based on more than ten years of experience, the software is capable of solving many small to medium sized structures more or less on its own. The innovative concept combined with the elaborate user interface makes the solution of crystal structures an almost routine process, especially for inorganic but also for many organic compounds.
Even unexperienced users can prepare and perform the structure solution calculation in a few steps: Simply follow the integrated "wizard" to enter the required data (unit cell parameters, chemical composition, diffraction data), and let Endeavour do the rest. The structure solution is performed using a special variant of the "direct-space" approach, namely a combined global optimization of the difference between calculated and observed diffraction data and of the potential energy of the system. Due to the additional usage of the potential energy, the method is much less sensitive to low-quality diffraction data than e.g. direct methods.
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