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SnapGene - 分子生物学软件

欢迎您接见环中1xBET!

一款分子生物学克隆软件
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SnapGene是一款多职能的分子生物学工具 ,可能直观的注解分析和DNA图谱 ,用于创建和共享注解文件 ,援手用户清澈地为分子生物学绘造有关图形 ,生物有关的用户不要错过!

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SnapGene可援手用户打算 ,可视化和纪录您的日常分析生物学法式 ,并为各人提供更安全的步骤 ,此刻DNA构建体都能够用电子体式纪录 ,它节俭了大量的功夫和金钱 ,并且方便使用者发现问题 ,造作决策和规划 ,软件界面敦睦 ,使用方便 ,是款很好的工具 。

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职能

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DNA可视化

查看DNA序列的多个视图

  • 地图:自界说 ,酶位点 ,引物 ,ORF ,DNA色彩等的显示 。地图可所以圆形或线性体式

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序列:使用双链模式查看酶位点 ,拥有翻译 ,引物和DNA色彩 。单链模式显示拥有彩色的紧凑概览

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  • 酶:从一系列酶组当选择 。剪切网站能够显示为数字或行 ,按名称或频率排序

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  • 职能:按名称、地位、大幼、色彩 ,方向性或类型对带注解的身分列表进行排序 。复选框在紧凑或发展的显示之间的切换 。

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  • 引物:按名称、地位、大幼、色彩、方向性或类型对带注解的身分列表进行排序 。复选框在紧凑或发展的显示之间的切换 。

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  • 汗青:查看DNA构建体的自动天生的图形汗青纪录 。

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大序列

浏览染色体大幼序列

  • 查看:利用SnapGene的数据处置职能 ,扫描具罕见千个带注解职能的大型DNA序列

  • 搜索:使用的MICA算法即时在染色体内找到序列

  • 缩放:使用多职能控件调整缩放系数和显示区域

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蛋白质可视化

查看蛋白质序列的多个视图

  • 地图:自界说区域、站点、键和序列色彩的显示

  • 系列:使器拥有有关职能的1或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列

  • 属型:查看蛋白质的分子量 ,消光系数 ,等电点和氨基酸组成 D芄欢缘鞍字实难《ú棵沤幸谎姆治

  • 属性:按名字、地位、大幼、色彩或类型对带注解的职能列表进行排序 。复选框在紧凑或发展的显示之间的切换

  • 汗青:查看自动天生的蛋白质序列图形汗青纪录 。蛋白质或DNA序列能够作为单独的文件再生

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直观的序列编纂

编纂DNA和蛋白质序列

  • 尺度编纂:进行插入、删除、代替和大幼更改 。复造并粘贴序列时 ,会自动传输职能

  • DNA实现:编纂线性DNA序列的结尾以增长或去除凸起端或磷酸酯

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序列色彩编码

将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种色彩之一

  • 给两条DNA链或蛋白质序列着色 。色彩在Map和Sequence视图中都可见

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属性注解

自动注解常用职能 ,或手动注解新鲜职能

  • 自动检测:使用SnapGene宽泛的数据库查找DNA序列中您选择的职能能够增长到自界说数据库中

  • 手动注解:选择DNA或蛋白质序列的一部门 ,并使用的GenBank兼容空间注解

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仿照

SnapGene提供优雅、信息的窗口 ,用于仿照常见的克隆换个PCR步骤

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限度性站点指标:确认限度性网站适合克隆

  • 属性:以粗体显示的限度性位点或选择自动界说的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组

  • 甲基化敏感性:限度性位点被Dam , Dcm或EcoKI甲基化阻断 。SnapGene将自动用星号象征该站点

  • 性质:利用工具提醒来预防有问题的限度网站

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限度性克隆

可视化克隆过程

  • 若是您已经筹备好了过程 ,那么仿照需几秒钟 。若是克隆过程存在设计缺点 ,则能够捕获并纠正谬误 。

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聚合酶链反映

仿照尺度PCR

  • 使用您自己的引物 ,或要求SnapGene自动设计引物 。产品文件在其汗青纪录上存储模板和引物 。

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沉叠延长PCR

通过沉叠延长PCR融合片段

  • 组装八个碎片 。选择要衔接的片段及其方向 ,SnapGene将设计引物 。

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引物定向诱变

使用诱变隐去进行定点诱变

  • 选择诱变引物 ,而后按按钮以查看建饰的质粒 。汗青色彩凸起了突变 。

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网关?克隆

仿照网关?BP克隆或LR克隆 ,或两者在统一功夫

  • 为了方便起见 ,提供了公共的供体向量和主张向量 。选择要组装的片段 ,Snap Gene将设计引物 。

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Gibson组装

通过融合八个片段或通过将八个片段插入向量来仿照Gibson Assembly 。Gibson Assembly是一种克隆步骤 。

  • 选择要融合的片段及其方向 ,Snap Gene将设计引物 。线性化的载体能够通过酶消化或反向PCR产生 。

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IN-FUSION?克隆

通过将八个片段插入载体来仿照Clontech的In-Fusion克隆 。融合克隆是创建基因融合的一种通用的步骤 。

  • 选择要融合的片段及其方向 ,Snap Gene将设计引物 。线性化的载体能够通过酶消化或反方向PCR产生 。

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TA和GC克隆

通过TA或GC克隆捕获PCR产品

选择通例TA克隆或高校GC克隆

  • 为了方便起见 ,通过了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体 。

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退火寡核苷酸

将两个寡核苷酸退火以形成双链产品

  • 使用的控件增长凸起端以进行限度性克隆 。

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预防谬误

使用SnapGene的结构是正确的 ,并确认已获得的序列 。

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基因融合阅读框

机关中的翻框架中 。

  • 链接的翻译

使用“序劣妆视图能够查看两个已翻译的身分是否在框架中 。若是这样 ,翻译将链接在统一行上 。若是不是 ,则翻译在单独的行上 。

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与参考序列比对

使用职能的对齐工具查抄现实结构是否与仿照结构匹配 。

  • 映射概述

查看比对序列与参考序列匹配的处所以及存在差距的概述 。

  • 序列具体信息

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自动纪录

SnapGene自动纪录操作以创建图形汗青纪录 ,并将原型机关在文件中 。

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“撤销”职能

撤销几何操作 。

尝试SnapGene文件而感应—沉复步骤 。

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汗青和原型

查看机关的图形汗青纪录

单击操作以凸起显示亲本和产品序列的有关部门 ,或单击PCR引物名称以查看引物序列 。

在汗青树中单击原型 ,以沉新天生该原型序列文件 ,其注解和克隆汗青纪录 。

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汗青色彩

使用可选的汗青纪录色彩来标识序列的更改

查看有关组装结构的具体信息 ,结扎的粘性结尾 。

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占有您的数据

SnapGene使您能够选择读取和共享文件 ,同时维持对数据的节造 。

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安全文件治理

将SnapGene文件保留在的地位 。

使用推算机上熟悉的安全操作系统来存储和组织SnapGene文件 ,

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从体式导入

读取常见的文件体式

导入DNA序列 ,还导入注解 。将持续开发进口商 ,以您不会被锁定的文件体式 。

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导出为尺度体式

将序列 ,图谱或凝胶图像转换为尺度体式 。将地图或仿照的穷糖凝胶导出为常见的图像体式 。

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与SnapGene Viewer共享数据

需将文件和链接发送到SnapGene Viewer 。就像的SnapGene界面一样 ,收件人将可能看到图 ,序列和注解 。

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SnapGene 7.0引入了更新的表观和加强的数据治理职能 。使用选项卡轻松导航文件和文件夹 ,并直接从新文件夹面板执行基于序列和元数据的文件搜索 。其他加强职能蕴含新的引物插入注解和各类可用性改进 。

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选项卡式界面

使用新的选项卡式界面在文档之间导航 ,或将文档弹出到单独的窗口中以进行比力 。

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文件和文件夹治理

选择文件系统上的肆意文件夹作为项目 ,并直接在新的可折叠文件夹面板中急剧查看子文件夹和文件 。执行尺度文件运作并急剧浏览所有支持的文件类型 。

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文件搜索

通过矫捷、现代的界面 ,使用名称或类型、蕴含序劣注特点注解等属性在项目中急剧查找文件 。

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入门注解

在更新的增长/编纂引物对话框中可视化增长到引物的插入 ,例如酶、密码子或短肽序列 。感兴致的区域(Golden Gate限度位点、Gateway克隆attB位点、定向TOPO基序)此刻也为自动设计的引物进行了注解 。

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预览检验到的新序列特点

新的文件窗格此刻蕴含一个序列图 ,用于预览序列中检验到的特点 ,并允许您选择要蕴含在序列中的注解 。

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起头

使用新的“入门”窗格急剧接见最近的文件和文件夹 ,或通过指向短视频教程、用户指南文章和SnapGene学院的链接相识有关若何使用 SnapGene 的更多信息 。

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系统要求:

Windows

SnapGene 5.1 - 6.0:Windows 7或更高版本(64位仅合用于Intel) 。 ?

SnapGene 6.1 - 7.0:Windows 10或更高版本(64位仅合用于Intel) 。 ?

基于ARM的推算机构建的Windows不支持SnapGene 。

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macOS

SnapGene 5.2.5或更早版本:macOS 10.12 。 ?

SnapGene 5.3 - 6.0:macOS 10.13或更高版本 。 ?

SnapGene 6.1 - 7.0:macOS 10.14或更高版本 。 ?

基于Apple ARM的推算机原生支持SnapGene 6.1版及更高版本 。

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Linux

SnapGene 4.0 - 5.2:Ubuntu 16.04、RedHat 6.6和7.2 。 ?

Snapgene 5.3 - 6.0:Ubuntu 18.04、CentOS 7 (1810)或RedHat 7.6 。 ?

SnapGene 6.1 - 7.0:Ubuntu 20.04、CentOS 8 (2105)或RedHat 8.4 。 ?

为基于ARM的推算机构建的Linux 不支持SnapGene 。

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硬件要求

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内存 1GB以上
硬盘 250MB可用磁盘空间
显示 分辨率1440×900或分辨率

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