SnapGene - 分子生物学软件
欢迎您接见环中1xBET!
SnapGene是一款多职能的分子生物学工具,可能直观的注解分析和DNA图谱,用于创建和共享注解文件,援手用户清澈地为分子生物学绘造有关图形,生物有关的用户不要错过!
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SnapGene可援手用户打算,可视化和纪录您的日常分析生物学法式,并为各人提供更安全的步骤,此刻DNA构建体都能够用电子体式纪录,它节俭了大量的功夫和金钱,并且方便使用者发现问题,造作决策和规划,软件界面敦睦,使用方便,是款很好的工具。
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职能
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DNA可视化
查看DNA序列的多个视图
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地图:自界说,酶位点,引物,ORF,DNA色彩等的显示。地图可所以圆形或线性体式
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序列:使用双链模式查看酶位点,拥有翻译,引物和DNA色彩。单链模式显示拥有彩色的紧凑概览
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酶:从一系列酶组当选择。剪切网站能够显示为数字或行,按名称或频率排序
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职能:按名称、地位、大幼、色彩,方向性或类型对带注解的身分列表进行排序。复选框在紧凑或发展的显示之间的切换。
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引物:按名称、地位、大幼、色彩、方向性或类型对带注解的身分列表进行排序。复选框在紧凑或发展的显示之间的切换。
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汗青:查看DNA构建体的自动天生的图形汗青纪录。
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大序列
浏览染色体大幼序列
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查看:利用SnapGene的数据处置职能,扫描具罕见千个带注解职能的大型DNA序列
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搜索:使用的MICA算法即时在染色体内找到序列
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缩放:使用多职能控件调整缩放系数和显示区域
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蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图
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地图:自界说区域、站点、键和序列色彩的显示
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系列:使器拥有有关职能的1或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列
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属型:查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成D芄欢缘鞍字实难《ú棵沤幸谎姆治
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属性:按名字、地位、大幼、色彩或类型对带注解的职能列表进行排序。复选框在紧凑或发展的显示之间的切换
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汗青:查看自动天生的蛋白质序列图形汗青纪录。蛋白质或DNA序列能够作为单独的文件再生
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直观的序列编纂
编纂DNA和蛋白质序列
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尺度编纂:进行插入、删除、代替和大幼更改。复造并粘贴序列时,会自动传输职能
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DNA实现:编纂线性DNA序列的结尾以增长或去除凸起端或磷酸酯
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序列色彩编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种色彩之一
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给两条DNA链或蛋白质序列着色。色彩在Map和Sequence视图中都可见
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属性注解
自动注解常用职能,或手动注解新鲜职能
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自动检测:使用SnapGene宽泛的数据库查找DNA序列中您选择的职能能够增长到自界说数据库中
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手动注解:选择DNA或蛋白质序列的一部门,并使用的GenBank兼容空间注解
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仿照
SnapGene提供优雅、信息的窗口,用于仿照常见的克隆换个PCR步骤
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限度性站点指标:确认限度性网站适合克隆
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属性:以粗体显示的限度性位点或选择自动界说的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组
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甲基化敏感性:限度性位点被Dam , Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号象征该站点
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性质:利用工具提醒来预防有问题的限度网站
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限度性克隆
可视化克隆过程
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若是您已经筹备好了过程,那么仿照需几秒钟。若是克隆过程存在设计缺点,则能够捕获并纠正谬误。
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聚合酶链反映
仿照尺度PCR
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使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其汗青纪录上存储模板和引物。
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沉叠延长PCR
通过沉叠延长PCR融合片段
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组装八个碎片。选择要衔接的片段及其方向,SnapGene将设计引物。
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引物定向诱变
使用诱变隐去进行定点诱变
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选择诱变引物,而后按按钮以查看建饰的质粒。汗青色彩凸起了突变。
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网关?克隆
仿照网关?BP克隆或LR克隆,或两者在统一功夫
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为了方便起见,提供了公共的供体向量和主张向量。选择要组装的片段,Snap Gene将设计引物。
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Gibson组装
通过融合八个片段或通过将八个片段插入向量来仿照Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种克隆步骤。
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选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体能够通过酶消化或反向PCR产生。
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IN-FUSION?克隆
通过将八个片段插入载体来仿照Clontech的In-Fusion克隆。融合克隆是创建基因融合的一种通用的步骤。
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选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体能够通过酶消化或反方向PCR产生。
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TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产品
选择通例TA克隆或高校GC克隆
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为了方便起见,通过了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
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退火寡核苷酸
将两个寡核苷酸退火以形成双链产品
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使用的控件增长凸起端以进行限度性克隆。
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预防谬误
使用SnapGene的结构是正确的,并确认已获得的序列。
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基因融合阅读框
机关中的翻框架中。
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链接的翻译
使用“序劣妆视图能够查看两个已翻译的身分是否在框架中。若是这样,翻译将链接在统一行上。若是不是,则翻译在单独的行上。
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与参考序列比对
使用职能的对齐工具查抄现实结构是否与仿照结构匹配。
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映射概述
查看比对序列与参考序列匹配的处所以及存在差距的概述。
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序列具体信息
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自动纪录
SnapGene自动纪录操作以创建图形汗青纪录,并将原型机关在文件中。
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“撤销”职能
撤销几何操作。
尝试SnapGene文件而感应—沉复步骤。
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汗青和原型
查看机关的图形汗青纪录
单击操作以凸起显示亲本和产品序列的有关部门,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
在汗青树中单击原型,以沉新天生该原型序列文件,其注解和克隆汗青纪录。
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汗青色彩
使用可选的汗青纪录色彩来标识序列的更改
查看有关组装结构的具体信息,结扎的粘性结尾。
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占有您的数据
SnapGene使您能够选择读取和共享文件,同时维持对数据的节造。
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安全文件治理
将SnapGene文件保留在的地位。
使用推算机上熟悉的安全操作系统来存储和组织SnapGene文件,
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从体式导入
读取常见的文件体式
导入DNA序列,还导入注解。将持续开发进口商,以您不会被锁定的文件体式。
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导出为尺度体式
将序列,图谱或凝胶图像转换为尺度体式。将地图或仿照的穷糖凝胶导出为常见的图像体式。
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与SnapGene Viewer共享数据
需将文件和链接发送到SnapGene Viewer。就像的SnapGene界面一样,收件人将可能看到图,序列和注解。
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SnapGene 7.0引入了更新的表观和加强的数据治理职能。使用选项卡轻松导航文件和文件夹,并直接从新文件夹面板执行基于序列和元数据的文件搜索。其他加强职能蕴含新的引物插入注解和各类可用性改进。
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选项卡式界面
使用新的选项卡式界面在文档之间导航,或将文档弹出到单独的窗口中以进行比力。
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文件和文件夹治理
选择文件系统上的肆意文件夹作为项目,并直接在新的可折叠文件夹面板中急剧查看子文件夹和文件。执行尺度文件运作并急剧浏览所有支持的文件类型。
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文件搜索
通过矫捷、现代的界面,使用名称或类型、蕴含序劣注特点注解等属性在项目中急剧查找文件。
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入门注解
在更新的增长/编纂引物对话框中可视化增长到引物的插入,例如酶、密码子或短肽序列。感兴致的区域(Golden Gate限度位点、Gateway克隆attB位点、定向TOPO基序)此刻也为自动设计的引物进行了注解。
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预览检验到的新序列特点
新的文件窗格此刻蕴含一个序列图,用于预览序列中检验到的特点,并允许您选择要蕴含在序列中的注解。
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起头
使用新的“入门”窗格急剧接见最近的文件和文件夹,或通过指向短视频教程、用户指南文章和SnapGene学院的链接相识有关若何使用 SnapGene 的更多信息。
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系统要求:
Windows
SnapGene 5.1 - 6.0:Windows 7或更高版本(64位仅合用于Intel)。 ?
SnapGene 6.1 - 7.0:Windows 10或更高版本(64位仅合用于Intel)。 ?
基于ARM的推算机构建的Windows不支持SnapGene。
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macOS
SnapGene 5.2.5或更早版本:macOS 10.12。 ?
SnapGene 5.3 - 6.0:macOS 10.13或更高版本。 ?
SnapGene 6.1 - 7.0:macOS 10.14或更高版本。 ?
基于Apple ARM的推算机原生支持SnapGene 6.1版及更高版本。
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Linux
SnapGene 4.0 - 5.2:Ubuntu 16.04、RedHat 6.6和7.2。 ?
Snapgene 5.3 - 6.0:Ubuntu 18.04、CentOS 7 (1810)或RedHat 7.6。 ?
SnapGene 6.1 - 7.0:Ubuntu 20.04、CentOS 8 (2105)或RedHat 8.4。 ?
为基于ARM的推算机构建的Linux 不支持SnapGene。
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硬件要求
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| 内存 | 1GB以上 |
| 硬盘 | 250MB可用磁盘空间 |
| 显示 | 分辨率1440×900或分辨率 |
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