DNA序列分析、比对与质；

更多文章 >>

• DNAMAN V10职能一览表：X与XL版性子能对比
• DNAMAN软件常见问答
• DNAMAN软件进行设计引物步骤
• 分子生物学利用软件DNAMAN的使用指南
• DNAMAN：分子生物学家常用的全能序列分析软件
• DNAMAN序列分析软件介绍

索求软件

?

Lynnon Biosoft 为激昂人心的基因组科学的教育、钻研和开发开发和销售生物信息学软件平台。1xBET产品 DNAMAN 软件包为序列分析和数据挖掘提供了一个有效的工具包。

?

什么是DNAMAN

DNAMAN合用于分析生物学利用的一体化软件包。该软件包为序列分析提供了一个就有多种职能的集成系统。您不再必要一个法式进行限度性分析
，而其他法式进行多序列对比、设计PCR引物、蛋白质序列分析或绘造质粒.....DNAMAN为您执行这些工作。

?

DNAMAN的速度、多职能性、正确性和高质量的演示使其成为每个分子生物学家能够依赖的根基工具之一。DNAMAN是多多评审科学期刊中高度引用的序列分析软件。他也是一个序列分析软件包
，每所大学、钻研机构、尝试室和钻研科学家都能够职守的起。

?

DANMAN可用于Microsoft Windows、OSX和Linux。三个平台上的DANMAN文件共享一样的体式。

DANMAN的通用体式系统方便了Windows、Mac OSX和Linux之间的通讯
，使您的平台独立。

?

?

DNAMAN 序列分析职能简介

• 序列分析集成系统

?

• Windows、OSX 和 Linux 上的 DNAMAN 桌面

?

?

合用于 Windows 的 DNAMAN

?

?

用于 OSX 的 DNAMAN

?

?

用于 Linux 的 DNAMAN

?

• 序列操作

1. 序列处置和转换

2. 序列输入

DNAMAN 序列是用关键字体式化的纯文本文件。该法式接受其他常见的序列体式
，例如 GenBank、GCG、CUSTAL、FASTA、PIR 和 GDE。DNAMAN 利用序列通路将活动序列保留在内存中以进行急剧推算。数据库也可用于援手组织特定钻研项主张序列。三个序列输入界面均可在 DNAMAN Desktop 上接见。

?

?

序列组成和转换

DNAMAN 使用单一的下拉菜单号令汇报序列组成和分子量。它能够将序列转换为其反向、互补、反向互补、双链和 RNA 序列。

?

?

• 序列搜索

列搜索

DNAMAN 提供用于序列搜索和比力的工具
，蕴含核苷酸或氨基酸序劣注共有序劣注盛开阅读框、沉复序列。幼滋扰 RNA (siRNA) 选择工具可用于提高 siRNA 设计的质量。用户能够在 DNAMAN 法式中对 NCBI 数据库或其他基于网络的序列服务器执行 BLAST 搜索。

?

?

• 限度分析

DNAMAN 为 DNA 序列的限度性分析提供直观的界面。了局能够显示为文本、限度图和限度模式（琼脂糖凝胶）。其他工具蕴含电子克隆、从片段沉建限度性图谱、静默突变和定向错配。

?

?

• 序列组装

DNAMAN 使用急剧正确的比对算法来组装大量序列。跟踪文件能够直接用于汇编。SNP能够通过组装的序列集进行验证。

?

?

• 同源比力

点阵图

能够使用点图在 DNAMAN 中分析大序列的同源区域。感兴致的序列区域能够放大并直接对齐。

?

两个序列比对

?

DNAMAN 提供了急剧或优化的算法来比对两个 DNA 或蛋白质序列。

?

?

• 多序列比对

DNAMAN 使用 ClustalW 算法（Feng-Doolittle 和 Thompson）进行对齐
，使用全局对齐算法（Wilbur 和 Lipman）进行急剧对齐。DNAMAN 中的三种比对提供了高质量的比对了局。使用急剧比对步骤
，您能够急剧比对大量 DNA 或蛋白质序列
Ｄ芄辉诙啾榷孕蛄斜嘧肫髦薪徊脚幕虻髡榷。

?

?

• 系统发育分析

DNAMAN 使用通用算法推算同源矩阵并成立全数序列对之间的有关距离。它能够天生距离矩阵
，并从多个比对中绘造系统发育树或同源树。自举分析可用于系统发育树的相信度值。

?

• 引物/寡核苷酸分析

PCR引物设计

DNAMAN 为 PCR 引物选择提供了节造尺度。您能够通过设置指标 DNA 的区域、PCR 产品的大幼、引物个性、反映前提和引物配置来优化引物过滤。

?

其他职能

能够分析寡核苷酸引物的解链温度、互补性、谬误引物、寡言突变和定向错配。

?

• 蛋白质分析

蛋白质序列分析

DNAMAN 提供了用于蛋白质序列分析的工具
，蕴含：从两个 DNA 链中翻译六个阅读框、遗传密码表的变异、阅读框概述、密码子使用分析、氨基酸组成、亲水谱、电荷和 pI 分析、二级结构预测和反向翻译。

?

?

• 数据库治理

DNAMAN 数据库治理

DNAMAN 使用尺度关系数据库引擎 Sqlite3 来治理 DNA/蛋白质序列和寡核苷酸序列。

?

?

• LBDraw（限 Windows）

LBDdraw的特点

?

?

• 在 Internet 上（限 Windows）

合用于 Windows 的内置 DNAMAN Internet/Intranet 浏览器

DNAMAN 提供了一个集成的 Web 浏览器来接见 Internet 或您的 Intranet。

?

?

?

【英文介绍】

?

Lynnon Biosoft develops and markets bioinformatic software platform for education, research and development of the exciting world of genome sciences. Our product, DNAMAN software package, provides an effective toolkit for sequence analysis and data mining.

?

What is DNAMAN?

DNAMAN is a one-for-all software package for molecular biology applications. This package provides an integrated system with versatile functions for high efficiency sequence analysis. You no longer need one program for restriction analyses and others for multiple sequence alignment, designing PCR primers, protein sequence analysis or drawing plasmids ... DNAMAN carries out all these tasks for you.

?

DNAMAN's speed, versatility, accuracy and high quality presentation make it one of the fundamental tools every molecular biologist can depend on. DNAMAN is highly cited sequence analysis software in numerous peer-reviewed scientific journals. It is also a sequence analysis software package with affordable prices for every university, research institution, laboratory, and research scientist.

?

DNAMAN is available for Microsoft Windows, OSX and Linux. DNAMAN files on all three platforms share the same formats. The common format system of DNAMAN facilitates the communication between Windows, Mac OSX and Linux, and makes your work platform-independent.

?