DNA Sequence Assembler是一款易于使用的生物信息学软件，用于自动DNA序列组装、DNA序列分析、沉叠群编纂、文件体式转换和突变检测


。

?

DNA Sequence Assembler是能够自动化组装过程的工具：

• 自动检测和建剪样品的低质量区域

• 自动建剪载体/引物序列

• 自动纠正沉叠群中的歧义

• 自动将contig保留到磁盘

?

使用DNA Sequence Assembler，您只需5秒即可从未组装的样本（拥有不成信结尾和向量的“dirty"样品）到结尾输出数据（沉叠群、算帐并保留到磁盘）


。

?

使用DNA Sequence Assembler，您还能够：

• 将多个DNA样本组装或比对到参考序列

• 按名称批量组装或对齐序列组（它将自动鉴别序列对）

• 浏览文件夹时预览FASTA序列和色谱图

• 查看、分析和编纂ABI、SCF、FASTA、SEQ、TXT、GBK序列

• 用色彩象征特定的色谱图区域（如差距、低质量区域）并急剧导航到这些区域

• 在分歧的文件体式（ABI、SCF、SEQ、FASTA、multi-FASTA、GBK...)之间进行转换或批量转换

• 检测双峰突变

• 检测两个（或多个）色谱图之间的突变

• 使用嵌入式碱基挪用水平沉新挪用未确定(N)碱基

• 沉新评估基础质量(QV)

• 使用同步的色谱图/组装网格/沉叠群图轻松概览您的项目

  ?

?

?

?

DNA Baser Sequence Assembler的重要的特点是它自动化了DNA序列组织过程


。只需将法式指向您的样本地点的文件夹，法式就会为您完玉成数步骤


。

?

一些主题职能是：

• 色谱图坏端的自动算帐

• 自动鉴别序列（载体、引物）算帐

• 自动更正contig中的吞吐碱基
  
  
  。您将始终不用编纂您的沉叠群

• 自动将contig、日志和项目数据保留到磁盘

• 自动引物检测和载体去除

• 自动批量组装
  
  
  
  Ｄ芄灰淮巫樽笆Ц龀恋群

• 组孜拷寮

• 色谱图和沉叠群之间的同步显示，这使得迷糊碱基的校对更快更方便

• 歧义/不匹配之间的急剧导航
  
  
  。只需单击一下即可跳转到下一个不匹配项

• 集成碱基检出器

• 色谱图查看器和编纂器（ABI和SCF）

• 项目图

• 正确度

• 将项目（输入序劣注沉叠群、用户编纂等）保留到磁盘以供以来查抄/编纂
  
  
  。您能够稍后将其他样本增长到您的conting

• 记住用户所做的根基编纂

?

嵌入式生物学工具

• 批量序列处置（批量实现建剪、向量去除、元数据集成、FASTA转换...）

• 批量元数据集成工具（只限RNA Baser）

• 克隆库取缔复造器

• 全数转换为multi-FASTA转换器

• 全数转换为FASTA转换器

• GenBank到FASTA转换器

• 反向补充

• 一键转换多种文件体式

?

?

【英文介绍】

?

DNA Sequence Assembler is revolutionary bioinformatics software for automayic DNA sequence assembly, DNA sequence analysis, contig editing, file format conversion and mutation detection.

?

DNA Sequence Assembler is the only tool that fully automated the assembly process:

• Automatically detect and trim low quality regions of your samples

• Automatically trim vector/primer sequences

• Automatically correct the ambiguities in your contig

• Automatically save the contig to disk

?

With DNA Sequence Assembler you need ONLY 5 (five) seconds to go from unassembled samples ("dirty" samples with untrusted ends and vectors) to the final output data (the contig, cleaned and saved to disk).

?

With DNA Sequence Assembler you can also:

?

• Assemble or align multiple DNA samples to a reference sequenceBatch assemble or align groups of sequences by name (it will automatically recognize sequence pairs)

• Preview FASTA sequences and chromatograms as you navigate through your folders

• View, analyze and edit ABI, SCF, FASTA, SEQ, TXT, GBK sequences

• Mark specific chromatogram regions (like discrepancies, low-quality areas) with colors & quickly navigate to these regions

• Convert or batch-convert between different file formats (ABI, SCF, SEQ, FASTA, multi-FASTA, GBK...)

• Detect double peak mutations

• Detect mutations between two (or more) chromatograms

• Use the embedded base caller to re-call undetermined (N) bases

• Reassess the base quality (QV)

• Easily overview your project using the synchronized chromatogram/assembly grid/contig map

?